어제 블로그와 별도로 운영중인 이 게시판이
트래픽 초과로 저도 접근할 수 없어 답변이 늦었습니다.
도면이 없어 어떠한 상황인지 확실히 파악은 안되나
A도면을 선택하여 B도면에 블록또는 외부참조 삽입시
A도면이 B도면에 "A"라는 이름으로 들어옵니다.
즉, 예를들어
A 도면에 "123" 이라는 이름의 블록이 있고
B 도면에 "456" 이라는 이름의 블록이 있을 때
A도면을 B도면의 "456" 대신 블록 대체하면
B도면의 "456"은 "123"이 아니라 "A"가 됩니다.

도면 자체가 블록이 되는 것이므로

도면 자체 이름으로 된 "A" 블록안에 "123" 블록이 또 있는 것이죠

따라서 원하는대로 "123"을 "456"으로 대체하려면
방법은 두가지입니다.
1. A 도면의 "123" 블록을 폭파
2. 폭파 안한 경우는 MDWG 옵션에서 "Explode"에 체크

질문자님의 글로 볼 때
대체한 도면안의 블록으로 대체된 것이 아니라
대체한 도면자체(도면 이름으로된 블록)로 삽입된 것 같습니다.
이 경우는 블록이 두번 잡히는 것이므로 블록안의 XCLIP로 들어와서
제대로 역할을 못한 것 같습니다.

따라서 다시 삽입할 수는 없을 것 같고
문제된 도면에서 대체한 블록만 선택해서 모두 폭파하면 될것 같습니다.
폭파하면 삽입 당시의 도면 이름은 폭파되고
삽입 당시의 도면 안에 있던 블록만 남을겁니다.

(대체한 블록만 선택하려면 드림의 FSE 명령 또는 캐드의 QSELECT 명령, 필터 명령 등
여러가지 방법이 있습니다)